Metrics on final quantification file with annotations
Priorité faible. Create a log file with some metrics of functionnal annotations contained into final file with quantification of reads on genes and functional annotations. (Par exemple, avoir un fichier de log avec le nombre de PFAMs et le % de reads associés à tous ces PFAMs et idem pour les GOs, etc.)
Voir le script qui permet de générer le fichier Quantifications_and_functional_annotations.tsv
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% de genes associés à un eggnog_id et à un diamond_id -
Demander à Géraldine pour le nombre de PFAMs et les % (globalement sur l'issue)
Edited by Claire Hoede