Documentation: update use_case.md with interpretations

Update use case with interpretations of results, for example:

• which are good metrics for a good assembly?

@claire.hoede : ajouter des warnings pour ce que tu as rencontré dans tes différentes utilisations de metagWGS. Exemple: ce qu'il faut vérifier après un kaiju (% de lectures affiliées à des bactéries, est-ce qu'il n'y a pas des bactéries en grand nombre auquel on ne s'attend pas, etc). @geraldine.pascal : pour quelle date aurais-tu besoin d'avoir cette page de la documentation terminée ?