03_filtering: Assess the impact of CPM and contig length filtering
A partir du bam des reads sur l'assemblage, représenter les différentes métriques d'assemblage (taille de l'assemblage, % de reads mappés, nombre de contigs) en fonction de différents seuils CPM et également de différentes longueurs de contigs minimum. Permet de visualiser l'impact du filtre sur l'assemblage et de ne pas relancer inutilement le filtre à l'aveugle plusieurs fois. On peut également imaginer de déterminer le seuil de filtre automatiquement à partir de ces résultats.
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